Их можно установить самим. Для этого нужно зайти в Manage/Sources, нажать сначала кнопку Edit в правом верхнем углу, затем кнопку Add в левом верхнем углу и ввести адрес. Список адресов самых известных репозиториев приводится ниже. Некоторые из них снабжены небольшими комментариями о том, что в них можно найти.

(RUS) http://apt.iguides.ru/ - темы, исправления, хаки, программы, игры, обои, рингтоны и.т.д.
http://cydia.hackulo.us - патчи AppSync, installous и т.д. (закрыт навсегда)
http://repo666.ultrasn0w.com - тут лежит патч для разлочки модема
(RUS) http://apt.alleon.name - темы, исправления, хаки, программы, игры, обои, рингтоны и.т.д.
http://repo.hackyouriphone.org - хаки, моды, программы и т.д.
http://www.sinfuliphonerepo.com - приложения, патчи и т.д.
http://ispaziorepo.com/cydia/apt/ - темы, исправления, хаки, программы, игры, обои, рингтоны и т.д.
http://repo.beyoip.com - темы, исправления, хаки, программы, игры, обои, рингтоны и т.д.
http://cydia.xsellize.com - программы, игры, картинки, мелодии
http://apt.saurik.com
http://apt.saurik.com/cydia-3.7 - Cydia репозитоии, unix утилиты, cycorder, хаки, программы
http://apt.thebigboss.org/dynamic/ - темы, исправления, хаки, программы, игры, обои, рингтоны и т.д.
http://apt.modmyi.com/dists/stable/main/binary-iphoneos-arm/Packages - темы, исправления, хаки, программы, игры, обои, рингтоны и т.д.
Список дополнительных репозиториев:

http://cydia.myrepospace.com/BluSky/ - все для iOS 4, темы, патчи программы и т.д.
http://c.ifon1.no - патчи, хаки, программы
http://iphone.hackndev.org/apt/ - хаки, программы, UaFix
http://app.ifonetec.com/cydia/ - программы Cylay и MiVTones
http://iphone.freecoder.org/apt/ - хаки, игры, патчи, логотипы
http://repo.smxy.org/cydia/apt/ - темы, исправления, хаки, программы, игры, обои, рингтоны и т.д.
http://urbanfanatics.com/cydia/
http://zodttd.com/repo/cydia/ - эмуляторы, quake4iPhone, Doom & VLC4iPhone
http://intelliborn.com/cydia
http://iphonestuff.ru/
http://jmiz9000.extroverthost.com - программа RockBand, хаки, патчи и т.д.
http://weho.ru/iphone/
http://steffwiz.webs.com/iPhone/Repo
http://cydia.iClarified.com
(RUS) http://repo.russianapple.ru/ - продукты ex-RipDev, твики, программы, фиксы и т.д.
http://irepo.ru/ - хаки, моды, программы и т.д.
(RUS) http://repo.i4iphones.info/ - хаки, моды, программы и т.д.
(RUS) http://apt.macmobile.ru/ - руссификатор сидии, патчи, моды, программы и т.д.
http://ihacksrepo.com - темы, патчи, моды, программы и т.д.
http://repo.ithemes.it/ - очень много красивых тем
http://idwaneo.org/repo - один из самых больших источников DLC (дополнительный контент в играх и приложениях)
http://mirrors.xbmc.org/apt/ios/ - XBMC - лучший бесплатный кроссплатформенный медиаплеер с открытым исходным кодом и аппаратным декодированием файлов